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우리가 합성한 물질의 구조를 확인할 때, GC-MS 나 MALDI-TOF-MS와 같은 분자량 측정을 합니다. 측정된 데이터를 보면 합성한 분자량 그대로 나오는 경우도 있지만, 분자구조 안에 특정 작용기가 있을 때는 끊어진 상태의 분자량의 피크들이 보입니다. 그래서 우리는 화학구조의 쪼개진 분자량을 확인할 필요가 있습니다.
이 글에서는 ChemDraw를 사용하여 분자량을 끊어서 확인하는 방법을 알아보겠습니다.
Mass Fragmentation으로 끊어진 분자량 확인하기
1. 먼저 확인하고자 하는 분자 구조를 그려 넣습니다.
2. 왼쪽의 Main Toolbar에서 Fragmentation Tools을 선택합니다.
3. 화학구조의 결합선을 가로질러 드래그를 해주면 아래와 같이 끊어졌을 때의 분자량과 Fomular를 확인할 수 있습니다.
Analysis Window로 끊어진 분자량 확인하기
1. 먼저 확인하고 싶은 구조를 그립니다.
2. 상단 메뉴의 'View'에서 'Show Analysis window'를 선택합니다.
3. 왼쪽 Main Toolbar에서 Lasso를 선택합니다.
4. 확인하고 싶은 분자의 부분만 드래그하여 묶어 줍니다.
5. Analysis Window를 확인하여 묶은 부분의 분자량을 확인합니다.
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