유기합성을 연구하는 사람들은 물질을 합성한 후, 잘 합성이 되었는지 확인하기 위해서 가장 먼저 수행하는 작업이 바로 NMR 측정입니다. 이 글에서는 ChemDraw로 NMR 예상 스펙트럼을 확인하는 방법에 대하여 알아보겠습니다. NMR 예상 스펙트럼이 필요한 이유 자신이 합성한 물질의 NMR 스펙트럼이 예상한 결과와 맞는지 살펴보면, 합성의 성공과 실패를 알 수 있습니다. 그렇기 때문에, 유기합성 관련 학과에서 개설되는 기기분석 과목 시간에 NMR 수업에 가장 비중이 크기도 합니다. 각 피크들이 어떻게 나올지 예상을 해야 자신이 합성한 물질이 어떤 물질인지 가늠할 수 있기 때문입니다. 하지만, 복잡한 구조를 합성한 뒤, 물질에 존재하는 탄소와 수소의 피크를 하나하나 계산하고 예상하는 것이 쉬운 일이 아닙..
ChemDraw에서 Analysis Window를 사용하면 문서창에 있는 모든 구조, 혹은 선택한 구조의 formula, exact mass, molecular weight, m/z 그리고 elemental analysis를 간단하게 확인할 수 있습니다. 이 글에서는 ChemDraw의 Analysis window를 사용하여, formula, exact mass, molecular weight, m/z 그리고 elemental analysis를 확인하고 각 요소들을 복사하는 방법을 알아보겠습니다. Analysis window 여는 방법 Analysis Window를 표시하려면, 상단 메뉴에 View-Show Analysis Window를 클릭하면 아래와 같이 Analysis Window가 나타납니다. An..
ChemDraw를 사용하면 SMILES를 화학구조로 변환할 수도 있고, 화학구조를 SMILES로 변환할 수 있습니다. 이 글에서는 SMILES가 무엇인지, 그리고 ChemDraw를 이용해서 SMILES와 화학구조를 자유롭게 변환하는 방법에 대하여 알아보겠습니다. SMILES 표기법이란? SMILES라고 하면 가장 먼저 떠오르는 단어는 '웃다'입니다. 하지만 화학에서 SMILES란, Simplified Molecular Input Line Entry System의 줄임말로, 1980년대 후반에 뉴 멕시코에 있는 회사 Daylight Chemical Information Systems가 만든 화학구조의 표기법입니다. 최근에는 AI 딥러닝과 화학의 융합연구가 활발해지면서 SMILES 구조의 활용이 폭발적으로 ..
약물 전달 시스템에서 가장 활발하게 연구가 되고 있는 부분이 무엇일까요? 바로 양친성 물질을 이용한 micelle, liposome 등이 있을 것입니다. 최근에는 mRNA 전달체 연구가 활발하게 진행되면서 Lipid Nanoparticle (LNP)도 떠오르고 있습니다. 바이오 분야 연구원 분들은 발표자료나 논문을 만들 때, 이 나노입자나 세포막의 membrane을 그려야 할 때가 있는데, 많은 분들이 그냥 구글에 있는 이미지를 가져오거나 선배들이 물려준 그림을 사용합니다. 하지만 저작권 문제에서 자유롭지 않고 원하는 그림을 그리기에 부족한 경우가 많습니다. 하지만 걱정하지 마세요. 우리는 ChemDraw를 이용해서 다양한 membrane을 그릴 수 있습니다. 이 글에서는 BioDraw Toolbar를 ..
ChemDraw로 구조를 그릴 때, 구조에서 오류가 발견되면 구조 주위에 빨간 상자가 표시됩니다. 이 상자를 Chemical Warnings이라고 합니다. 이 상자가 뜨면, 우리는 구조를 잘못 그렸을 수도 있기 때문에, 다시 한번 구조를 확인해 봐야 합니다. 이 글에서는 Chemical Warnings의 빨간 상자를 없애는 방법과 이 빨간 상자를 설정하는 방법에 대해서 알아보겠습니다. Chemical Warnings 표시 없애기 하지만 이 Chemical Warning 상자가 때때로 거슬리기도 합니다. 문서 전체의 Chemical Warnings 없애기 현재 사용하고 있는 문서 창에서 이 상자를 없애기 위해서는, 상단 메뉴에 View-Show Chemical Warnings에 체크표시가 되어 있다면, 한..
ChemDraw의 가장 큰 장점이 무엇일까요? 우리가 원하는 화학구조를 자유롭게 그릴 수 있다는 것입니다. 결합선의 길이와 각도를 원하는 대로 그릴 수 있지만, 웬만하면 깔끔하게 그리는 것이 좋겠죠? ChemDraw로 화학구조를 깔끔하게 그리는 방법은 두 가지가 있습니다. 하나는 처음부터 구조를 정확한 각도와 길이로 결합선을 그려 나가는 것입니다. 하지만, 결합선을 그리다보면 구조가 복잡해지거나 결합선이 겹치게 되는 경우들도 있습니다. 이런 문제를 해결해주는 기능이 바로 'Clean Up Structure' 입니다. 이 글에서는 Clean up Structure 기능을 이용해서 구조를 깔끔하게 정리하는 방법과 단축키를 알아보겠습니다. Clean Up Structure를 이용하여 구조 정리하기 아래의 구조..